一图读懂艰难梭菌
Trends in Microbiology[IF:11.776]
① 艰难梭菌是一种可形成孢子的厌氧肠道致病菌；② 艰难梭菌拥有4.3Mb大小的环状基因组，耐热，耐氧，耐基于乙醇的抗菌剂，但可被1:10稀释的次氯酸钠杀死；③ 艰难梭菌主要可产生两种毒素：TcdA及TcdB，均为可抑制Rho、Rac及Cdc42的葡糖基转移酶；④ 艰难梭菌感染（CDI）可造成严重腹泻，甚至引起死亡，复发率约为13.5%，致死率约为1.3%，CDI主要风险因素为抗生素使用；⑤ CDI的模式生物包括：仓鼠、小鼠、大鼠、野兔、仔猪、土拨鼠、马驹、鹌鹑。
Clostridioides difficile
10-05, doi: 10.1016/j.tim.2018.09.004
Science子刊：肠道菌群失调促艰难梭菌感染的新机制
Science Translational Medicine[IF:16.71]
① 将腹泻患者失调的肠道菌群移植给无菌小鼠；② 小鼠暴露于艰难梭菌后，肠道氨基酸浓度增加且艰难梭菌菌感染（CDI）易感性升高；③ 一种无法利用脯氨酸的艰难梭菌突变体无法感染移植了失调/健康人类菌群的无菌小鼠；④ 移植了失调菌群的无菌小鼠中，低脯氨酸或低蛋白饮食预防性干预、或进行预防性粪菌移植，可抑制野生型艰难梭菌在小鼠体内的扩增；⑤ 综合抗生素、住院、免疫抑制、先前CDI等风险因素，可预测腹泻患者的肠道菌群失调及CDI易感性。
Clostridioides difficile uses amino acids associated with gut microbial dysbiosis in a subset of patients with diarrhea
10-24, doi: 10.1126/scitranslmed.aam7019
【主编评语】Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，发现在腹泻患者中，肠道菌群失调可增加肠道中的游离氨基酸（特别是脯氨酸），艰难梭菌可利用这些氨基酸作为能量来源，从而促进艰难梭菌感染。另外，在一项对腹泻患者的回顾性队列研究中，鉴定出一些临床风险因素（抗生素、住院、免疫抑制、先前的CDI），可预测肠道菌群失调及更高的CDI易感性。
Cell子刊：肠道细菌通过分泌抗生素抑制艰难梭菌生长
Cell Chemical Biology[IF:5.592]
① 胆汁酸7α-脱羟基肠道细菌——Clostridium scindens和Clostridium sordellii，可分别分泌色氨酸衍生的抗生素，1-乙酰基-β-咔啉和turbomycin A；② 两种抗生素均可通过抑制细菌分裂时隔膜的形成，以抑制艰难梭菌和其他肠道细菌的生长；③ 次级胆汁酸（脱氧胆酸和石胆酸）增强了这些抗生素的抑制活性；④ 艰难梭菌可通过分泌脯氨酸环二肽以抑制肠道菌群的其他细菌，增强自身在抗生素治疗后定殖于结肠中的能力。
Bile Acid 7α-Dehydroxylating Gut Bacteria Secrete Antibiotics that Inhibit Clostridium difficile: Role of Secondary Bile Acid
10-25, doi: 10.1016/j.chembiol.2018.10.003
【主编评语】来自Cell Chemical Biology上发表的一项最新研究发现，肠道中的某些细菌可通过分泌抗生素，以抑制艰难梭菌的细胞分裂，从而抑制后者的生长，而次级胆汁酸可增强这种抑制活性。
益生菌产品Bio-K+或可用于艰难梭菌感染的初级预防（综述）
Journal of Hospital Infection[IF:3.354]
① 纳入24项研究（6项药效及药物动力学研究、4项安全性研究、1项成本效益研究、3项随机对照临床试验、10项干预试验）；② 分析Bio-K+益生菌产品（嗜酸乳杆菌CL1285、干酪乳杆菌LBC80R、鼠李糖乳杆菌CLR2的组合）用于艰难梭菌感染（CDI）的初级预防的效果；③ 使用Bio-K+可降低CDI发生率，或可作为使用抗生素的患者用于CDI的初级预防；④ Bio-K+抑制艰难梭菌感染的可能机制包括：调节肠道菌群、直接抑制艰难梭菌生长、中和艰难梭菌毒素。
Primary prevention of Clostridium difficile infections with a specific probiotic combining Lactobacillus acidophilus, L. casei, and L. rhamnosus strains: assessing the evidence
08-01, doi: 10.1016/j.jhin.2018.04.017
【主编评语】Journal of Hospital Infection上发表的一篇综述文章，对一种上市于1996年的益生菌产品Bio-K+（包含嗜酸乳杆菌CL1285、干酪乳杆菌LBC80R、鼠李糖乳杆菌CLR2）预防艰难梭菌感染的效果及机制进行了介绍。
Science重磅综述：肠道菌群链起饮食和健康
Science[IF:41.058]
① 菌群可用碳水化合物(MAC)、脂肪、蛋白、微量营养素和食品添加剂深入影响肠道菌群和人体健康；② 生酮、古式、素食、地中海、限定碳水化合物饮食及发酵食品或对特定人群有益，但亟需结合菌群进行深入研究；③ 饮食干预商业化在加速，但大量基础性问题未解决，且大部分理论基础源自动物模型；④ 菌群可塑性很强，但这是双刃剑，不恰当干预方法或适得其反；⑤ 未来需明确对饮食快速响应的关键微生物，并结合多组学、新算法等建立个体化干预方案。
The gut microbiota at the intersection of diet and human health
11-16, doi: 10.1126/science.aau5812
【主编评语】2018年11月16日上线的Science杂志，以封面形式推出了“饮食和健康”专辑，发表了4篇重量级综述。其中关于肠道菌群的文章，系统性阐述了不同的饮食成分对肠道菌群、代谢产物的深入影响，进而阐述了相关进程对人体细胞、代谢、生理功能以及慢性疾病发生的至关重要作用，也对未来需要解决的问题提出了展望。文章内容非常扎实，三张图举例说明了目前被了解得最深入的菌群相关代谢过程。这篇综述是开放下载的，值得专业人士逐字逐句认真阅读，我们也特别将图改造成了一图读懂，希望能帮助读者了解核心内容。强烈推荐！
Science：膳食脂肪并非“敌人”（综述）
Science[IF:41.058]
① 饮食中碳水化合物/脂肪比例（C/L）对肥胖、糖尿病、心血管疾病和癌症的影响复杂，低脂饮食和低碳水化合物饮食在不同研究中分别显示出促健康作用；② 脂肪、碳水化合物的来源以及分子特性，会影响二者对机体健康的作用；③ 不存在通用的最优膳食C/L，重视营养成分质量的情况下，健康膳食中C/L的浮动范围很大；④ 需要加大科研投入，深入研究膳食中C/L、营养物质质量对健康的影响；⑤ 代谢异常和糖尿病病人等群体，需要更有针对性的饮食结构。
Dietary fat: From foe to friend?
11-16, doi: 10.1126/science.aau2096
【主编评语】膳食中碳水化合物/脂肪比例对健康的影响广受关注。本综述回顾了一系列膳食与慢性疾病的关联性研究，总结了营养学界在膳食成分比例、质量对健康的影响方面的分歧和共识，指出膳食中碳水化合物/脂肪比例对健康的影响还缺乏定论，同时也肯定了特定条件下调整膳食成分比例的促健康潜力。
Science：科学禁食有益健康（综述）
Science[IF:41.058]
① 大量动物研究和小型临床试验显示，热量限制、限时进食、隔日/周期性禁食、模拟禁食饮食等饮食干预策略，对很多慢性疾病有预防和改善作用，可延缓衰老；② 这些饮食模式以减少热量摄入和/或定期禁食为核心，各有特点和优劣，主要通过作用于多个长寿调节通路、调节生理和代谢节律、将能量从生长和繁殖向维持、抗逆和修复转移等机制，保护细胞、改善代谢和健康；③ 研发整合营养平衡、餐量控制和科学禁食的饮食方法，将有助于促进健康老化。
A time to fast
11-16, doi: 10.1126/science.aau2095
【主编评语】营养不足和过剩都不利于身体健康。以热量限制和禁食为核心的饮食干预方法，是近年的一大研究热点，很多研究显示，这些饮食模式可改善健康、延缓衰老。Science本周发表综述，详细讨论了热量限制、限时进食、周期性禁食和模拟禁食饮食等饮食模式的作用，及其改善健康的潜在机制，并对未来研究方向提出了建议，很值得一读。
Cell：促胰液素介导的餐后生热作用及饱足感
Cell[IF:31.398]
① 肠道分泌的促胰液素在餐后褐色脂肪组织（BAT）的生热作用中扮演了重要作用；② 促胰液素受体（SCTR）在BAT中高表达，进食后，小鼠血液循环中促胰液素升高；③ 促胰液素通过与BAT中的SCTR结合以激活脂解作用，从而激活BAT的生热作用，同时，信号可传至大脑并引起饱足感；④ 人促胰液素可提高食源性肥胖小鼠的能量消耗；⑤ 在人体试验中，进食导致的生热作用与餐后的促胰液素水平相关，注射促胰液素可增加BAT对葡萄糖的摄取。
Secretin-Activated Brown Fat Mediates Prandial Thermogenesis to Induce Satiation
11-15, doi: 10.1016/j.cell.2018.10.016
【主编评语】进食可引起褐色脂肪组织（BAT）的生热作用，但分子机制尚未明确。Cell上发表的一项重要研究中，发现促胰液素在其中起到了关键作用。进食后，促胰液素水平升高，通过激活BAT产生生热作用，同时，该信号可传递至大脑并引起饱足感。
Cell：对食物的感知如何让肝脏提前做好准备？
Cell[IF:31.398]
① 看+闻食物，可瞬时激活小鼠肝脏中的mTOR信号及其下游的Xbp1 mRNA剪接，增加内质网（ER）应激基因表达、促进磷脂酰胆碱合成，从而引起ER发生形态学改变，为即将到来的营养做好适应性准备；② 感知食物可使下丘脑中抑制食欲的阿黑皮素原（POMC）神经元迅速活化，经交感神经“通知”肝脏，该过程依赖于黑皮质素4受体；③ 肝脏中的去甲肾上腺素信号使mTOR和Xbp1信号活化；④ 对食物的感知经黑皮质素-SNA-mTOR-Xbp1轴，引起肝脏ER的适应性改变。
Food Perception Primes Hepatic ER Homeostasis via Melanocortin-Dependent Control of mTOR Activation
11-15, doi: 10.1016/j.cell.2018.10.015
【主编评语】看到食物的样子，闻到食物的气味，都可以让身体为食物的消化吸收提前做好准备。Cell本周发表的研究，阐释了对食物的感知如何快速地让肝脏“预见”即将到来的营养并为之做好准备。
世纪坛医院+中科院计算所+华中科大：长期出国的人，菌群如何变化？
Gut[IF:17.016]
① 10名北京志愿者在国外生活6个月，肠道菌群逐渐转变为当地模式，回国后又很快恢复；② 研究过程中，厚壁菌门和拟杆菌门表现出较强的恢复性，且变化趋势相反，变形菌门和放线菌们也有一定可塑性；③ 追踪比较受试者共同的OTU，发现在国外生活期间，归属于上述四个细菌门的OTU具有独特的时间动态；④ 随着地区和饮食习惯的改变，肠道菌群具有双向可塑性和恢复性，在临床应用和诊断菌群疾病应注意饮食习惯和出行记录，并长期监测疗效。
Resilience of human gut microbial communities for the long stay with multiple dietary shifts
11-12, doi: 10.1136/gutjnl-2018-317298
【主编评语】研究表明，短期的饮食变化可改变健康人或疾病患者的肠道菌群组成。来自世纪坛医院、中科院计算所及华中科大的团队在Gut上发表的一项最新研究，对10名在国外生活了6个月的北京健康志愿者的肠道菌群进行了追踪分析，发现肠道菌群表现出了很强的可塑性和恢复性：在国外时，菌群组成趋向于当地的模式，而回国后，菌群又可很快恢复。
Nature子刊：低麸质饮食怎样影响健康人的肠道菌群和代谢？
Nature Communications[IF:12.353]
① 纳入60名健康中年丹麦人进行随机、对照、交叉试验：低谷蛋白饮食和高谷蛋白饮食分别干预8周，中间间隔至少6周的常规饮食清洗期；② 与高谷蛋白饮食相比，低谷蛋白饮食引起肠道菌群适度变化，减少空腹和餐后的氢气呼出量，并引起受试者自我报告的腹胀改善；③ 低谷蛋白饮食对糖脂代谢无显著影响，降低体重和选择性地减少炎症小体反应的激活；④ 结论：低谷蛋白饮食干预会引起肠道菌群和复杂碳水化合物发酵的变化。
A low-gluten diet induces changes in the intestinal microbiome of healthy Danish adults
11-13, doi: 10.1038/s41467-018-07019-x
【主编评语】越来越多的人开始尝试低谷蛋白饮食，但其对健康人的影响尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究，在60名健康中年人进行了一项随机对照交叉试验，发现低谷蛋白/麸质饮食可改变肠道菌群，减少氢气呼出量并改善腹胀，降低体重并减少炎症小体激活。
Science子刊：肠道菌群怎样促进衰老相关胰岛素抵抗？
Science Translational Medicine[IF:16.71]
① 在小鼠和猕猴中分析与衰老相关胰岛素抵抗有关的菌群和免疫因素；② 衰老引起肠道菌群变化和菌群产物丁酸减少，Akk菌的丧失使肠道完整性受损，导致内毒素等炎性菌群产物易位；③ 当丁酸水平下降时，易位的菌群产物可激活CCR2+单核细胞，使网膜中的天然免疫细胞B1a转化为4BL细胞，后者表达的4-1BBL可激活其受体信号引发胰岛素抵抗；④ 直接补充或用恩诺沙星增加Akk菌、补充丁酸、减少CCR2+单核细胞或4BL细胞，均可恢复衰老动物的胰岛素反应。
Commensal bacteria contribute to insulin resistance in aging by activating innate B1a cells
11-14, doi: 10.1126/scitranslmed.aat4271
【主编评语】人体衰老与胰岛素抵抗（IR）和免疫失调相关，肠道菌群可能是二者背后的共同因素。Science Translational Medicine发表的最新研究，在小鼠和猴子中揭示了肠道菌群作用于免疫细胞进而促进衰老相关IR的新机制，Akk菌和丁酸也在其中扮演中药角色。该研究表明，对菌群-单核细胞-B细胞轴的靶向干预，可能是逆转衰老相关IR的潜在方法。
林圣彩等：碳水化合物不是“妖魔”，均衡饮食有益健康
Cell Metabolism[IF:20.565]
① 随着代谢性疾病发病率的升高，碳水化合物一度被妖魔化，各种低碳水饮食也随之增加；② 最新研究在肿瘤细胞中发现，葡萄糖可通过一种新的代谢途径消耗活性氧（ROS）转化为乙酸，被细胞利用或进入循环，从而保护细胞；③ 一项对43万名参与者随访25年的研究显示，低碳水饮食可增加死亡率，50%~55%的碳水摄入死亡率最低；④ 以上研究对“高碳水摄入总是有害”的观点提出警示，我们仍应该回归到原始的智慧——均衡饮食带来健康。
Carbohydrates: Not All that Bad?
11-06, doi: 10.1016/j.cmet.2018.10.004
【主编评语】近年来膳食碳水化合物有被“妖魔化”的趋势，来自厦门大学林圣彩团队的评论文章近期在Cell Metabolism发表，总结了近期一项Cell研究发现的葡萄糖的细胞代谢新途径，对细胞有潜在保护作用，提示人们过度追求低碳水饮食未必是最健康的选择。
我们真的补足了维他命么？
PNAS[IF:9.661]
① 人体蛋白质可分为生存性和长寿性，缺乏营养物质时长寿蛋白被优先牺牲，恶化衰老相关疾病；② 长寿维生素（LV）是维持长寿蛋白及其功能的膳食成分，区别于生存型维生素和必需矿物/元素（V/M）；③ LV涵盖若干生存型V/M、条件性维生素以及潜在功能物质，包括维生素K和D、硒、镁、ω-3脂肪酸（DHA和EPA）、胆碱、牛磺酸、麦角硫因、吡咯喹啉醌、醌和类胡萝卜素；④ 由于未考虑LV对长寿的影响，现有V/M摄入标准很可能低于健康所需量。
Prolonging healthy aging: Longevity vitamins and proteins
10-15, doi: 10.1073/pnas.1809045115
【主编评语】世界范围内维生素和必需矿物/元素（V/M）缺乏问题可能大于预期。本文总结了10余种V/M对长寿及相关疾病的影响，提出了长寿维生素这一概念，认为目前的V/M摄入标准未考虑营养物质缺乏对衰老的影响，很可能低估了人体长寿所需的V/M量。该观点对重新审视维生素、微量元素的作用、制定合理膳食标准和促进中老年健康具有参考价值。
童年逆境可影响孕期的肠道菌群组成和应激炎症反应
Brain Behavior and Immunity[IF:6.306]
① 分析48名孕妇的童年逆境（ACE）经历问卷和肠道菌群，及其中19名孕妇的特里尔社会压力试验结果；② 高ACE（≥2个ACEs）孕妇普雷沃菌含量更丰富；③ 鉴定出与皮质醇、IL-6、TNF-α、C反应蛋白曲线下面积水平显著相关的肠菌类别；④ 高ACE女性通过饮食摄入ω-3多不饱和脂肪酸（DHA和EPA），可调节IL-6水平，抑制急性应激炎症反应，起到潜在保护作用；⑤ 多重童年逆境与孕期肠道菌群组成变化有关，这些变化可能影响压力下的炎症和糖皮质激素水平。
Childhood Adversity Impact on Gut Microbiota and Inflammatory Response to Stress During Pregnancy
11-03, doi: 10.1016/j.bbi.2018.11.005
【主编评语】孕期的炎症反应可对孕妇和胎儿发育产生不良影响，Brain Behavior and Immunity发表的一项研究表明，童年逆境可影响孕期的肠道菌群组成，与孕期的应激炎症反应水平相关，而摄入ω-3多不饱和脂肪酸可能有保护性作用。这些发现对研究童年逆境中的肠-脑轴机制有参考价值，并提示饮食干预或能改善相关孕期应激炎症反应。
肠道菌群参与饮酒引起的肠道和神经炎症
Journal of Neuroinflammation[IF:5.193]
① 雌性小鼠中，慢加急性酒精摄入（持续10天少量摄入+一次急性酗酒）可诱导小鼠大脑和肠道炎症，使大脑皮质和小肠中多种促炎细胞因子表达增加、大脑皮质和海马体中的小胶质细胞活化和形态改变；② 摄入酒精同时每天口服抗生素，使小鼠血液内毒素降低、肠道细菌含量大幅减少，显著抑制了上述酒精摄入引起的变化，提示肠道菌群参与慢加急性酒精摄入诱导的炎症；③ 抗生素还使部分炎性体组分表达增加。
Reduced gut microbiome protects from alcohol-induced neuroinflammation and alters intestinal and brain inflammasome expression
10-27, doi: 10.1186/s12974-018-1328-9
【主编评语】饮酒引起的肠道菌群改变可促进肝损伤，本研究显示，肠道菌群在饮酒诱导的肠道和神经炎症中也起介导作用。