长期未清洗的空调存在很多微生物、粉尘、细菌、真菌等，开启时若不进行清洗很容易引起呼吸道感染。
早在2004年底卫生部就在全国60多个城市，对近千家宾馆、商场等公共场所的集中空调进行抽检，结果显示卫生合格率只有6％。其中风管污染是最主要原因，抽检的近千家宾馆中，风管积尘超标最严重的高达476倍。
风管污染产生原因：
空气中各类悬浮物不能完全被中央空调过滤装置所阻隔,中央空调所使用的粗效过滤器只能阻隔40%的可悬浮颗粒物，部分灰尘颗粒进入管道堆积；
微细颗粒与风道内壁产生静电吸附，灰尘也就越积越厚；
堆积的灰尘极易滋生各类微生物，如：病毒、细菌、军团菌、冠状病毒等；
风道内部温、湿度适宜于各种病菌和昆虫滋生并寄生于其中，甚至有老鼠及蟑螂存在。
2006年，卫生部对全国集中空调的抽检结果也印证了这个问题。检测发现由于风管污染的原因，空调所送空气的卫生质量问题最为严重，细菌总数全国平均超标36.9％，可吸入颗粒物超标29.6％。
2008年，有研究者对深圳、北京地区家用空调进行微生物污染问题及其消毒效果的调查。
并不意外的发现，深圳地区细菌及真菌总数的平均值分别为891.96 cfu/cm2，799.86 cfu/cm2，北京地区细菌及真菌总数的平均值分别为3866.48 cfu/cm2，127.83 cfu/cm2，报告的数据均超过2012年《公共场所集中空调通风系统卫生规范》规定细菌总数和真菌总数菌落数应≤100 cfu/cm2。
同时，不仅细菌的种类多，细菌总量也超量。按照安全标准，空调出风口的细菌数，一立方米不得超过500个。而测试数据显示，细菌总数为523，真菌总数为820，极大的超出安全范围。
其中，军团菌是潜藏在集中空调里最致命的杀手。如果集中空调受到军团菌的污染，人们很容易感染军团菌病。
上海空调清洗行业协会副秘书长王彬在接受新民晚报采访表示，中央空调开之前最好先“洗个澡”。目前本市公共场所基本实现集中空调定期清洗消毒全覆盖，但商务楼宇方面还没能引起足够重视。
“据不完全统计，商务写字楼集中空调的定期清洗率仅为20%-30%，大量集中空调长期未进行清洗。”
有研究者对北京市14家大饭店（四、五星级）中央空调38个冷却塔进行军团病的病原学检测，结果显示所调查的饭店中12家空调冷却塔有军团菌污染，污染率达85.7%，有21个冷却塔检出军团菌，阳性率为55.3%（21/38），共分离16株军团菌，均为嗜肺军团菌种。
军团菌常伴随空调制冷装置中随冷风吹出，该病尤其易发生在配备有密闭式中央空调的办公环境里，感染者出现上呼吸道感染及发热的症状，严重者可导致呼吸衰竭和肾衰竭。
杭州市第一人民医院呼吸内科副主任沈凌医生告诉“医学界”：
“ 军团菌的确是夏天多见，与使用空调有一定关系，但由于大多数医院缺少诊断手段，所以基本上根据临床判断的。患者主要特点是高热、干咳无痰、肺外症状明显（腹泻、低钠血症），通常C反应蛋白增高明显，以及肌酸激酶增高明显。”
军团菌病主要的感染途径是人吸入被污染的气溶胶。
气溶胶来源包括空调冷却塔、冷热水系统、加湿器、温泉等。
军团菌病发病的季节分布、年龄分布和性别分布特征各地基本一致。6-10月为高发季节，发病高峰为8-9月；在已报告的病例中，在年龄分布上，老年人发病多，男性多于女性。
怎样预防呢？
1、加强水资源管理及人工输水管道和设施的消毒处理，防止军团菌造成空气和水源污染，这是预防军团菌病扩散的重要措施；
2、医院、办公楼、商场、机场、地铁站等大型建筑物，要对中央空调系统，冷却塔等设备进行定期检测，保持这些设备冷热水系统的清洁；
3、对自己家里的空调，浴室里的淋浴器等设备也要进行定期检测、消毒，保持其卫生清洁。李涛等人的研究调查显示，家用空调经过消毒后，细菌总数及真菌总数杀灭率均超过95%。
复旦大学附属中山医院呼吸科张新教授也再次强调：
“对空调，特别是中央空调系统要清理打扫，尽量让空调冷凝液少积聚；汽车玻璃水要用不利于细菌繁殖的液体，比如用含清洁剂的，不要直接用清水；对非典型肺炎的患者要注意军团菌肺炎的诊断性检测，以免延误病情、产生严重后果。”
参考资料：
[1] 彭晓旻,裴红生,黎新宇, 等.北京市大饭店空调冷却塔军团菌污染现况及人群感染水平研究[J].中华流行病学杂志,2000,21(4):289-291. DOI:10.3760/j.issn:0254-6450.2000.04.014.
[2] 李涛,周铁生,李睿, 等.家用空调微生物污染问题及其消毒效果的研究[J].中国预防医学杂志,2010,11(1):66-69.
[3]空调不清洁=直接吃毒！央视记者亲身揭秘空调到底有多脏！-微信公众号：乐活记