港中大黄秀娟：肠道真菌可影响粪菌移植对CDI患者的疗效
Nature Communications[IF:12.353]
① 艰难梭菌感染（CDI）患者存肠道真菌失调，白色念珠菌富集，真菌多样性、丰富度和均匀度降低；② 粪菌移植（FMT）对CDI的治愈效果，与来自供体的细菌和真菌分类群在患者肠道中的定殖有关；③ FMT后，疗效较好的应答患者中，酵母属和曲霉属的相对丰度较高，而不应答患者和抗生素治疗的患者中念珠菌属占优；④ 供体粪便中白色念珠菌丰度较高，与FMT疗效降低相关；⑤ 小鼠实验证实，白色念珠菌可削弱FMT治疗CDI的效果，抗真菌治疗可改善。
Gut fungal dysbiosis correlates with reduced efficacy of fecal microbiota transplantation in Clostridium difficile infection
09-10 DOI: 10.1038/s41467-018-06103-6
NEJM：肠道细菌阻碍肝癌免疫应答会发生在人体中吗？
New England Journal of Medicine[IF:79.258]
① Ma团队的研究发现，用抗生素减少肠道梭菌属细菌可增加初级胆汁酸，通过增加肝窦内皮细胞表达CXCL16来抑制肝脏肿瘤，初级胆汁酸被梭菌属细菌代谢为次级胆汁酸后，对肝癌的免疫应答作用相反；② 虽然肝癌患者的CXCL16表达与初级胆汁酸存在相关性，但人类和小鼠的免疫系统、肠道菌群和胆汁酸的组成不同，Ma团队研究成果的临床意义有限；③ 单纯的饮食干预对减少肿瘤负荷的作用有限，应考虑开发针对特定细菌、胆汁酸受体的治疗手段。
Bile Acids, the Microbiome, Immunity, and Liver Tumors
08-30 DOI: 10.1056/NEJMcibr1807106
饮食如何影响菌群与心血管疾病（综述）
Journal of Nutrition[IF:4.398]
① 肠道菌群组成及其在肠道微环境中的初级和次级代谢产物与心脏代谢性疾病风险相关；② 饮食可以改变肠道环境和菌群，并为菌群代谢提供底物，因此评估不同类型的饮食模式与疾病之间的关联意义重大；③ 地中海式饮食指多吃水果蔬菜及海鲜坚果等清淡营养的食物，临床追踪试验也发现地中海式饮食或者素食主义有助于降低心脏代谢性疾病发生；④ 这种饮食方式有助于产生短链脂肪酸，减少三甲胺及次级胆酸生成；⑤ 健康饮食对于预防心血管疾病非常重要。
Dietary Patterns Affect the Gut Microbiome—The Link to Risk of Cardiometabolic Diseases
08-31 DOI: 10.1093/jn/nxy141
抗抑郁药引起大肠杆菌的多重耐药性
Environment International[IF:7.297]
① 大肠杆菌K12暴露在不同浓度的氟西汀中，可增加突变频率，并增加对氯霉素、羟氨苄青霉素及四环素的耐药性；② 分离出对至少一种抗生素具有耐药性的突变菌株，发现一些菌株对氟喹诺酮、氨基糖苷类抗生素、β内酰胺、四环素及氯霉素产生了多重耐药性；③ 通过对转录组及蛋白组进行分析，发现AcrAB-TolC泵、YadG/YadH转运蛋白、Tsx通道及MdtEF-TolC泵共同触发了抗生素的外排；④ 全基因组分析揭示，ROS介导的突变上调了外排泵的表达。
Antidepressant fluoxetine induces multiple antibiotics resistance in Escherichia coli via ROS-mediated mutagenesis
08-18 DOI: 10.1016/j.envint.2018.07.046
Lancet子刊：如何应对非酒精性脂肪肝？
The Lancet Diabetes and Endocrinology[IF:19.313]
① 非酒精性脂肪肝（NAFLD）是一种异质性疾病，成因与不健康的生活方式、年龄、基因等相关；② 超声是临床诊断NAFLD的常用方法，血清学以及其他影像学（如核磁共振）检测可作为辅助诊断手段；③ 末期NAFLD患者常伴有心血管疾病、胰岛素抵抗、2型糖尿病等并发症，对风险人群尽早诊断、对症治疗；④ NAFLD的治疗主要针对纤维化治疗和心血管代谢治疗，目前还没有一个标准化的治疗方案，需要多因素方法联合处理，生活方式的转变尤为重要。
Non-alcoholic fatty liver disease: causes, diagnosis, cardiometabolic consequences, and treatment strategies
08-30 DOI: 10.1016/S2213-8587(18)30154-2
Gut：NAFLD中的肠道菌群代谢物（综述）
Gut[IF:17.016]
① 除遗传和环境因素外，肠道菌群及其产物的变化也参与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的发病；② 肠道屏障功能紊乱可促进NAFLD，但研究显示仅少数患者存在肠道通透性和菌群产物移位增加；③ 菌群衍生代谢物作用于不同的受体和通路，影响代谢和NAFLD，三甲胺、一些次级胆汁酸、乙酸和丙酸、内源性乙醇等可促进NAFLD发病，丁酸可抑制NAFLD；④ 琥珀酸、苯乙酸和3-(4-羟苯基)乳酸酯等菌群产物，或能作为生物标志物用于NAFLD的检测。
Small metabolites, possible big changes: a microbiota-centered view of non-alcoholic fatty liver disease
08-31 DOI: 10.1136/gutjnl-2018-316307
Nature Reviews：肠道菌群及其代谢物在NAFLD中扮演什么角色？
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:16.99]
① 非酒精性脂肪肝（NAFLD）的疾病进展中，肠肝轴有重要作用；② 肠道菌群的组成和功能改变、支链氨基酸（BCAA）和芳香族氨基酸（AAA）及其菌群代谢物（如3-(4-羟苯基)乳酸酯），都被证实与NAFLD及其风险因素相关；③ Hoyles等整合肥胖女性NAFLD患者的粪菌宏基因组和表型组数据，开发了基于菌群特征的NAFLD无创检测方法；④ 菌群衍生代谢物可能调节肥胖者的代谢健康，AAA的菌群代谢物苯乙酸在NAFLD的疾病进展中有潜在关键作用。
Gut microbiome, microbial metabolites and the development of NAFLD
08-29 DOI: 10.1038/s41575-018-0058-x
同济大学等：NAFLD中肝脏胆汁酸信号通路受损
Gut[IF:17.016]
① 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者的血清初级和次级胆汁酸浓度上升，但抑制FXR的脱氧胆酸比例增加，而激动性的鹅脱氧胆酸比例减少；② 患者肝脏中参与胆汁酸合成、转运和调控的多个基因表达发生改变，血清FGF19降低，说明患者中FXR和FGF4介导的信号转导受损；③ 患者肠道中牛磺酸和甘氨酸代谢细菌增加，表明次级胆汁酸生成增多；④ 高脂饮食喂养的大鼠中存在与患者相似的上述变化；⑤ 包括肠道菌群在内的FXR信号通路组分，是NAFLD干预的潜在靶点
Suppressed hepatic bile acid signalling despite elevated production of primary and secondary bile acids in NAFLD
08-03 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-314307
浙大一院李兰娟：丁酸盐改善小鼠NASH
Frontiers in Microbiology[IF:4.019]
① 56只小鼠分为4组，分别喂食甲硫氨酸-胆碱充足（MCS）或不足（MCD）的食物，并补充或不补充丁酸钠，干预持续6周；② 补充丁酸盐可缓解MCD饮食引起的菌群失调，减少嗜胆菌属及理研菌科，富集有益菌属（包括Akk菌、粪球菌属等）；③ 并改变了脂质、硬脂酸、山酸、十八烯酸、亚油酸、鲨烯、花生四烯酸等的代谢通路；④ 补充丁酸盐则可有效改善肝损伤、纤维化进展、炎症、脂代谢及肠道屏障功能障碍，且与肠道菌群及粪便代谢产物变化相关。
Butyrate Protects Mice Against Methionine–Choline-Deficient Diet-Induced Non-alcoholic Steatohepatitis by Improving Gut Barrier Function, Attenuating Inflammation and Reducing Endotoxin Levels
08-21 DOI: 10.3389/fmicb.2018.01967
肝硬化患者的肠道菌群特征，与临床结局相关
Clinical Gastroenterology and Hepatology[IF:7.683]
① 分析181例肝硬化患者入院时的粪便菌群特征与之后30天内临床结局间的关联；② 患者中8%发展为慢加急性肝衰竭（ACLF）、16%转入重症监护、21%死亡，有/无上述结局的患者间，菌群β多样性差别显著，发展出ACLF（尤其伴随肾衰竭）的患者，菌群失调更严重；③ 变形菌门中肠杆菌科、弯曲杆菌科和巴斯德菌科、厚壁菌门中肠球菌科和链球菌科，与不良结局相关，而厚壁菌门中毛螺菌科和梭菌目可降低不良结局风险；④ 菌群变化与多种不良结局独立相关。
Association Between Intestinal Microbiota Collected at Hospital Admission and Outcomes of Patients with Cirrhosis
07-20 DOI: 10.1016/j.cgh.2018.07.022
BMJ：肝硬化和肝癌死亡率在美国呈上升趋势
British Medical Journal[IF:23.259]
① 观察性队列研究表明，从1999年至2016年，美国每年肝硬化死亡人数增加65%、肝细胞癌死亡数上升1倍，死亡率在不同族裔和州之间存在差异；② 校正年龄因素后，肝细胞癌死亡率每年上升2.1%，肝硬化死亡率从2009年开始上升，至2016年增加3.4%；③ 25-34岁人群的肝硬化相关死亡率的平均年增长率最高（10.5%），主要因素是酒精相关肝脏疾病；④ 肝硬化相关的腹膜炎和败血症死亡率显著增加。
Mortality due to cirrhosis and liver cancer in the United States, 1999-2016: observational study
07-18 DOI: 10.1136/bmj.k2817
Cell：衰老和热量限制如何影响肝脏代谢通路的节律性
Cell[IF:31.398]
① 在小鼠中分析年龄和热量限制（CR）对肝脏和肌肉/表皮干细胞基因表达的影响；② 肝脏的节律性转录组中，蛋白乙酰化和NAD+代谢通路富集，而干细胞中则是DNA损伤应答通路具有明显节律性；③ 衰老使节律性转录组发生组织特异性变化，肝脏中蛋白乙酰化的节律性随衰老消失，而CR可强烈促进蛋白乙酰化；④ CR使肝内NAD+及其代谢物水平上升，经NAD+-SIRT1-AceCS1途径，促进节律性的乙酰辅酶A代谢和基因启动子组蛋白乙酰化，重塑肝脏的节律性转录组。
Circadian Reprogramming in the Liver Identifies Metabolic Pathways of Aging
2017-08-10 DOI: 10.1016/j.cell.2017.07.042