2005年美国俄亥俄州通过法律，在中小学生物教科书中删除有关进化论的内容，另外几个州随即跟进；美国联邦教育部门也就此展开激烈辩论。
达尔文的进化论自问世以来，争议质疑不断。进化论有几个致命的缺陷至今无法得到解释，例如找不到物种过渡形态化石。因为按照进化论的理论，进化是连续渐进，不是跳跃的，那么就应该有连续的化石样本。达尔文认为这是因为发现的样本太少，并预言随着生物考古学的发展一定会有大量中间物种化石被发现。他自己曾多次说过，今后100年中如果找不到中间物种化石，那么进化论就是错误的！可到现在200年过去了，古生物学在各方面取得了突飞猛进的进展，唯独“中间物种”没有被发现！另外一个问题是如果物种是进化来的，那么容易想象，现存物种不应该如此整齐，应该地球上存在大量的非驴非马的生物。经历了物种进化的几十万年，物种怎会如此一致呢？比如人，应该有些已经进化到人，有些进化了80％、50％……怎么会人和猿的界线如此分明呢？ 难怪达尔文晚年自己也不再相信进化论。
进化论认为人类由偶然中产生，进化即无目的又无方向。进化论已成狭隘自负，丧失了科学的求真探索精神，甚至拒绝对任何进化论体系外的现象进行观察和研究。他们认为科学是研究存在和获取知识的唯一途径，凡是现代科学无法证实的，无法研究的，都是不真实的，进化论就是绝对的真理，他们把自己封闭在一个小圈子里，不愿向外迈出一步。根据进化论的结论，人只是复杂的生物机器，道德、信仰都不存在，也无向善弃恶的精神意志，这完全回到了十九世纪的机械唯物主义，是人类思想的重大倒退。可悲的是，这是信奉进化论的必然结果。
进化论不仅误导了整个生物学，而且误导了心理学、伦理学和哲学等许多领域，误导了人类文明的发展。它给人类文明造成的明显或潜在的祸害，是触目惊心的：它让人将宗教和道德善恶视为欺骗，败坏精神寄托和道德制约；它告诉人们弱肉强食，不择手段竞争发展自己；让人误信反传统或反潮流的畸变可能出现更进化的、更好的结果；让人误信人是动物的后裔、人的本性来源于禽兽；进一步发展认为：人的欲望是人最本质的本性，甚至是进化出的最好的本性，为物欲横流和伦理的败坏从科学上解除了约束，这种宣传已经充斥了社会的方方面面。种种此类败坏的因素渗透进现代常人社会的一切，潜在地推动了人类道德的退化。
人们一心“进化”自己，一面放纵地发展着自己，一面在紧张的竞争和顾虑中生存，越来越自私，当自私欲望得不到满足时，各种不道德的行为和犯罪愈演愈烈了。人们失去了理解和信任，在社会上失去了安全感。短暂的享受和荣耀，换取着无可挽回的一切：道德滑坡、心理畸变、利欲膨胀、两极分化、怪病丛生、无休止的竞争、社会的畸形发展、资源的耗竭、环境的污染与破坏……
失去了道德的约束，人们失控地发展私欲，造成了无可挽回的一切。如今到了必须破除进化论的迷信的时候了。
一些人总在维护着过去的错误，他们任意否定事实，少数权威造成的舆论，成了先入为主的禁锢框架，公众很难了解实情，这是科学与人类社会的悲哀。
进化论至今都只是一种假说，当年达尔文希望将来能发现确凿的证据，可是经得起检验的证据至今也没有找到，而且进化论的理论与事实也出入太大，论证漏洞百出，结论也无法重复。严谨的学者清楚：接受的人多并不能将一个假说上升为真理，真理需要严密的推理和无可辩驳的证据，这正是进化论所缺乏的。
进化论者为了急于证明从猿到人的理论，饥不择食，闹了不少类似的笑话。例如1922年有人在美国内布拉斯加州发现了异样的牙齿，便急不可耐地宣布为猿人的牙齿，甚至准备作为人类进化的证据列为1925年的科学要闻。但五年后全副骨骼出土，其实不过是一种绝种的野猪。不仅猿和人之间没有过渡型态，在任何特征相近，被认为有进化关系的物种之间，都找不到过渡形态。很多人费尽气力，试图去寻找那些所谓迷失的环节（Missing link），却始终徒劳无功，一无所获。如果不同物种果真系进化而来，这种现象不是很难理解吗？难怪连达尔文本人晚年也不再相信自己的进化学说。
自从遗传学发明之后，证实每种生物的种子，都有它独有的、特别的因素；这因素包含着那种生物的特性和本能。除非经过人力，故意使种子中的某一个因素，失去功用，才能使它生出的生物暂时改变。然而到了第二代时，仍旧复原。换句话说，因子是不变的，临时灭去，下代仍旧复原；另外加一点减一点都是不可能。这是证明物种是不变的。
当年达尔文在加拉帕戈斯群岛（位于东太平洋赤道上，属厄瓜多尔）考察时，发现各个岛屿上的雀类形态不同，自然选择作用促使这些雀类向不同方向演化所致。以此为起点，他逐步发展出进化的观点。但据现今学者重新研究，发现这些岛上的生态条件实不足以使岛上的雀类发生这些形态变化。这些变化的真正原因是各个岛上的雀群只能进行隔离繁殖（雀类不善远飞，各岛之间的海域足以使之互相隔离），各雀群之间没有遗传基因的交流，因此各雀群的总体基因内涵（基因库）逐渐产生差异因而造成雀群形态上的差别。这与各岛的环境条件无关。如果两个雀群的基因库不同，即使它们的生活环境完全一样，其形态也会有分别。反之亦然。
达尔文当时并没有现今的遗传学知识，他不能正确理解这一现象的真正本质，所以产生了进化的误解。今天我们已经认清了事实真相，为什么还要沿袭达尔文的错误观点？然而有些人仍然不愿扬弃进化学说，原因是百余年来进化论已经形成一个根深蒂固的庞大体系，牵连着太多人的现实利益，盘根错节，积重难返。
从遗传学看来，由脱氧核糖核酸（DNA）所组成的遗传信息链是一个极其匀整而又极其稳定的双螺旋结构，它能不断地分裂和复制自身而保持结构不变。这便是：种瓜得瓜、种豆得豆。各种生物都是各从其类，瓜不能变豆，鹿也不能变马。异类杂交常不能成孕，或使子代不育（例如马和驴杂交的后代骡），这也是因为它们的遗传基因结构各不相同所致。任何对这一信息结构的干扰破坏均导致畸形变态，此即所谓突变。严格地说，突变实为畸变，它不但不能促使物种进化，反而将导致退化和衰败。无数天然和人为的事实都说明这一点。物种为什么会突变？无非是因为遗传基因在某些物理的、化学的因素影响之下发生结构改变所致。于是有人用X光、放射性元素或化学毒素去处理果蝇等实验动物，结果突变果然出现了，但人们所得到只是一些奇形怪状的畸变个体，并不能创造更进步、更高级的新种系。然而这正是进化论突变论者企图让我们相信的。
为了弥补进化学说诸如此类的破绽，从达尔文时代至今，进化论的论点就一直在变，直到最近，仍然继续不断有新的论点出现。这一现象说明，迄今为止，并没有任何一个论点真正可信，否则就不必众说纷纭了。试想，如果进化论具有万有引力定律那样明确的可信性，还需要修修补补吗？目前的进化论与达尔文时代已经有了显著的差别。为了弄清进化论的真相，有必要对此略加探讨。其间的差别主要有三点：
第一，现今的进化论者虽然尚未完全放弃突变说，但已承认突变在进化中的作用微不足道，而且承认绝大多数的突变（99.9%以上）都是有害，当然不能促成进化。在这一点上，现今的进化论者较其前辈有进步。
第二，达尔文认为所有物种都是由最初的单细胞生物进化而来。至于这个单细胞生命又从何而来，达尔文没有明确交代。但他并不相信单细胞生物可以由无生物自动进化而来。他仍然认为在生物与非生物之间有一条难以逾越的鸿沟。所以他认为单细胞生命的出现，需要一个最初的推动。既然是推动，当然就不是自动进化。
而现今的进化论者，则认为进化的原则不单适应于生物，也适用于非生物，甚至整个宇宙都在进化当中。非生物物质可以自动由简单到复杂，由低级至高级，并由非生物进化为原始的生物。但这一观念明显与已知的科学原则相违背，它违反热力学第二定律，它违反著名的巴斯德原理。如果这一观念属实，则作为现代医学基础的微生物学和消毒灭菌、无菌操作等原则便全部毫无意义。因此，它很难为稍具科学常识的人所接受。于是他们辩解说，由无生物到生物的进化过程在现今的世界上虽已不可能重演，但在远古地球幼年时期，那时的原始世界犹如一个容有特种培养基的大烧瓶，在当时的特殊条件下，空气和水中的氨和碳氢化合物可能自动结合为氨基酸，氨基酸又可能结合为蛋白质。然后在蛋白质的基础上，由于某种特殊原因，终于迸发出生命的火花，形成第一个单细胞生物，完成从量变到质变的飞跃，于是如此这般，终于进化为今天洋洋大观的生物世界。但这种神话式的理论，既不曾为任何人所目睹观察，又不能以实验作重复验证，更无任何客观事实为依据，这与科学究竟有何相关？由此可知，现今的进化论者实在比达尔文更加主观武断。
迄今为止，所有蛋白质都是某种生物以其特有的模式在酶的作用下合成的，否则，无论有多少氨基酸都无济于事，而酶则都是生物产物。请问，在生物出现以前酶从何而来？不少科学家曾使用昂贵的器材设备，力求用人工方法合成蛋白质，但他们的努力一概以失败告终。试问，有意识、有目的、有科学步骤的实验尚且不能做到的事，难道无意识的偶然事件能做到吗？那么酶能否自动生成呢？按照酶体的结构，如果能自动合成的话，则一种酶的自动合成机率为10^20之一（10的20次方分之一），这已经是近于不可能的事，而问题还在于单独一种酶并无多大用处，必须有多种酶同时作用方可。而酶的种类则不下两千种之多，于是总的机率是10^20×2000=10^40000分之一，这是一个超乎人类想像能力之外的数字，根本没有实践意义。我们姑且假定酶的种类不是两千，而是仅有两种，则其自然合成机率为10^40分之一，我们再假定酶的合成反应能以每秒钟一百亿次的超高速度进行（这是不可能的），则仍然需要3×10^22年，即三百万亿亿年方有一次成功的机会。但地球的寿命只有46亿年，宇宙的寿命也只有150亿年，那就是说，宇宙的寿命必须再延长两万亿倍方有一次同时合成两种酶的机会。这是可能的吗？更何况蛋白质并不等于生物，即使是最简单的单细胞，其构成也极其复杂。生命绝不仅仅是蛋白质存在的形式那么简单。任何细胞要生存，至少必须有一层外膜将它自己与外界分别开来。这层膜允许它自外界吸取营养，却不许无用的物质进入；又允许它向外界排放代谢废物，却不许有用物质散失。这种半透膜就不是蛋白质，而且至今仍是人类所不能制造的。任何生物要继续存在就必须繁殖，就必须有遗传物质，而遗传物质也不是蛋白质。所以仅仅有蛋白质决不能构成生命。
第三，现今的进化论者得益于遗传学的新成就，力图将进化学说建立在基因的基础上。不同于以前的突变说，他们现在强调渐变的作用。即由于遗传因子的多样性，生物在繁殖过程中，子代个体与亲代均有微小的差别，此即所谓微进化。这些微小的差别经过千年万代的积累可成为巨大的变化，形成显进化。如果同一物种的两个种群为高山大海等所隔离，不再有基因的交流，则在微进化及其它因素的作用下，各种群的总体基因库即可能出现极大差别。这种现象称为基因漂移，是导致种群进化、并造成新物种的基本动因。这种说法显然比突变说圆滑得多，但也并不令人信服。
因为各种生物两代之间的差别，只是个体或种群的特化，并不是进化。这些变化虽然多种多样，却仍然在各个物种特征的框架之内，并不能超越种际的界限。例如，狗在长期人工培育下，其体型已有很大差别，小者似猫，大者似豹。但它们决不能小如鼠，大如象。而且这些变化都是可逆的。如果任凭各种狗自然混交繁育，很快就会变为野狗的体型，归回狗的本态。各物种的基因为数众多，通过两性繁殖，可以形成近于无限的组合方式，唯其如此，才能使所有个体除了有种族的共性之外，尚各有其个性，不会有两个个体完全相同（同卵孪生例外）。各种群若长期分隔，也会表现出种群的不同特征。这是生物繁衍的正常现象，与进化无关。各从其类并非各从其形，并非同一物种的所有个体一概形貌雷同，千篇一律。然而尽管人类分化为不同的族群，各有肤色、毛发、体形上的特征，但那并不是进化。人还是人，并没有进化为超人或非人的新种，不同种族的人可互相婚配，可生育正常的后代。说明他们仍然属于同一个人种。现代进化论者说，如果两个种群互相隔离过久，它们的基因库就可能相差太多，以致可能再互相交配，而成为两个不同的新种。但这也是想当然而已。试图制造新种的人工试验从来没有成功过，在自然界也难以找到可信的例证。所谓基因漂移，是在正常的繁衍过程中逐步实现的，并不包括突变的因素，可知基因成份仍是该物种所固有的，并无新的成份，当然就不会构成新种，也就无所谓进化。
随着时间的推移，进化论暴露的问题越来越多。大量史前文明近年来相继发现，用进化论根本无法解释。
越来越多的科学家反对进化论。中华网科技讯，500多名美国科学家联合签名反对达尔文的进化论：“我们对达尔文的进化理论表示非常怀疑。我们对达尔文进化论中的自然选择理论表示怀疑。我们认为，作为科学家，我们有责任要求各领域科学界进行一系列更加深入的研究，以确定达尔文的理论是否合理”。在这篇反对文章上签名的科学家共有514名，其中有154名生物学家、76名化学家、63名物理学家，其余为毗邻学科。文章作者认为，达尔文进化理论狭窄的框架根本容纳不了地球生命的起源与未来发展进程。
美国Leigh大学教授Behe发表了《达尔文的黑箱》(Darwin's BlackBox)一书。该书以大量无可辩驳的事实证明，进化论迄今为止也仅能被视为一个假说，决不是什么终极的真理。相反，其地位已岌岌可危。新西兰分子遗传学家Danton在其《进化：危殆的理论》中言明：进化论是20世纪生物界最大的谎言。
在此将进化论存在的问题和一些鲜为人知的事实公诸于世，将理智思考的机会留给每一个人。
8.1 史前人类的问题被掩盖了
1880年，美国加利福尼亚的太波山下出土了许多精巧的石器工具，鉴定后确认这是5500万年前的人类遗迹，而根据进化论那时根本不可能存在人，完全打破了进化论人类进化的体系。然而，这个惊人的发现很快被莫名其妙地‘淡忘’了。
1966 年，墨西哥的霍亚勒克出土了一批铁矛，美国地质学家麦金泰尔博士奉命去鉴定。她用了两种方法测定了铁矛的年代，得到了同样的结果：距今25万年。这个违背进化论的结果实在让科学界无法接受。一个欧洲学者迫於各方面的压力，改成了人们愿意接受的年代。而麦金泰尔，这位在国际上有一定声望的教授，却从此失去了在相关领域里工作的一切机会。
已故的考古学家阿曼塔也遭遇了类似的命运。他在墨西哥的普瑞拉瓦城发现了一个史前动物的颌骨，里面有一块残破的铁矛的矛头，鉴定发现是26万年前的武器，一些刊物公布了这个不寻常的发现，但很快招来权威们不做任何调查的批判，阿曼塔的事业也从此被扼杀。
这类故事还有不少。一些人总在维护着过去的错误，他们任意否定事实。少数权威造成的舆论，成了先入为主的禁锢框架，公众很难了解实情。
随着时间的推移，进化论暴露的问题越来越多。一些进化论学者开始反戈一击，他们根据事实对进化论谨慎地提出了疑问，自然毫无例外地招来了经验性的批判。但是，事实毕竟是事实，理论的困惑，吸引探求真理者。
8.2 进化论的三大证据相继破灭
进化论有三大经典证据：比较解剖学、古生物学和胚胎发育重演律，在近年来的研究中相继瓦解。
8.2.1 比较解剖学，暴露了进化论的逻辑错误：循环论证
科学上，如果一个理论的证明违背逻辑，这个理论就不能成立，但是人们对进化论的逻辑错误却没有深纠，也是因为深纠起来，就没有证据可言了。例如用比较解剖学来论证进化，形象地说就是：“如果人是猿进化来的，人和猿就会有许多相近的特征；因为人和猿有许多近似之处，所以人就是猿进化来的。” 这是典型的“循环论证”，换一个通俗的说法更清楚些：“如果甲是乙的弟弟，甲就比乙小；因为甲比乙小，甲就一定是乙的弟弟。”一听后面就不对，因为甲比乙小，可能甲乙没有任何亲缘，还可能甲是乙的叔叔呢（如果甲辈份大）。这种逻辑错误的典型--循环论证毫无意义。
这种似是而非的“证明”贯穿于进化论所有的论据之中，学者都对此习以为常了，人云亦云，人们盲从地接受了它。当我们严格分析，会大吃一惊！即便不十分懂逻辑的人也能发现这种证明是在诡辩。
8.2.2 胚胎发育重演律逻辑上不能立足，理论上禁不起推敲，事实上是一个观察错误
19 世纪，德国的海克尔提出了重演律学说，认为高等生物胚胎发育会重现该物种进化的过程。其实重演律本身就是假说，这个假设就成了进化论的重要证据：如果进化存在，胚胎发育的‘重演现象‘很像在反映进化的过程；因为有重演现象，进化就是存在的。这不但运用无意义的循环论证，而且掩盖了最关键的一点：谁也不明白 ‘重演现象‘和进化有什么关系，硬说成是因果关系。
其实，重演律是在生物学还很不发达的时候提出的假说，随着遗传学的出现和分子生物学的发展，特别是对基因的深入研究，重演论失去了理论依据。既然过去的基因已经突变成新基因了，怎么还重现过去的特徵呢？就重演律本身，古生物学家古尔德也指出了该理论的致命缺陷，这些已是共识了。
现在，很多学者证明了重演律是一个观察错误。德国人类胚胎学家布莱赫施密特（Erich Blechschmidt）所著的《人的生命之始》（The Beginnings of Human Life）一书中，以详尽的资料证明人的胎儿开始就都是人的结构，例如以前认为胎儿早期出现的象鱼一样的‘鳃裂‘，实际是胎儿脸上的皱褶，完全是人脸的结构，被硬说成‘鳃裂‘。胎儿在9毫米左右，身体下端的突起好像是尾巴，其实没有任何尾巴的结构特徵，那是一条中空的神经管，它发育较快，向阻力小的方向生长，暂时向末端突出，很快就平复了。而且它是有重要作用的，根本就不是残迹器官。
对罕见的畸形病：毛孩和长尾巴的小孩，进化论认为那是人祖先的特徵；要按这么推理，没有大脑的畸形更多，那人的祖先就没有大脑了？先天肢体残缺的、多长手指、脚趾的也常见，那么人的肢体就是从各种畸形进化来的？跳出进化论的思想框框一想，就会发现所谓的‘返祖现象‘只是畸形或缺陷而已，是基因畸变的反映，和人类祖先联系在一起毫无道理。
英国胚胎学家李察逊，组织了十七个单位的科学家，研究了50种不同脊椎动物的胚胎及其生长过程，并且仔细观察、记录。并联名在1997年8 月的Anatomy & Embryology学报上发表了他们惊人的结果：即“海克尔的胚胎”是生物学上最“著名”的骗局。
根据李察逊研究，重演律有许多疑点：例如，为了将人的胚胎画得像鱼一样，海克尔将人胚胎的鼻子、心脏、肝脏等大部份的内脏，及手、脚的胚芽都挖掉，再加长脊椎成尾巴！他还随意加添。例如鸡的胚胎，在这时期的眼与其他动物不同。它是没有色素的，而海克尔则将它涂黑，使它与其他动物看齐。还有，海克尔在大小比例上也随意更改，他的伸缩性可达十倍，以增加不同胚胎的相似性。海克尔刻意选用不同动物作为代表，却隐瞒这些代表的种名，使人以为同纲的动物一定都是一样的。
原来当年海克尔还在德国Jena大学任教期间，他伪造的这些假图就已经被人揭发。李察逊为了证实这遮掩了100多年的骗局，亲自到Jena大学去调查。证实海克尔当年被同事指控，他不但承认伪造，并且被判有罪。所以，至今在德国的课本中找不到海克尔的图画。
8.2.3 古生物学上，至今没有找到确凿的证据：进化中的过渡类型
如果进化存在，必然存在进化过程中物种之间的过渡类型，否则进化就是谬论。在逻辑上，过渡类型的化石也就成了进化论的三大证据之一；而事实上，这方面并没有确凿的证据可用，达尔文等人猜想20世纪会找到明确的证据，也就是当时用‘猜想‘作了证据：这又是极不严肃、可靠的。事实又是怎样呢？直到现在，发掘出的化石不计其数，禁得起推敲和鉴定的证据还没有一例。
曾经轰动一时的始祖鸟，曾被视为进化论的铁证，6具“始祖鸟化石”的相继问世，轰动了世界，因为它即具有爬行动物的特征，又具有鸟类的特征而被视为鸟类和爬行动物之间过渡物种的典范。后来鉴定出5具是人造的，剩下的1具坚决拒绝任何鉴定。最初的“发现者”坦白了造假的原因之一：太信进化论了，就造出了最有力的证据。
从猿到人的问题上，寻找过渡物种‘类猿人‘，早就列入了科学的‘十大悬案‘。数次宣布的人类始祖，很快就被否定了。例如1892年发现的人和猿之间的过渡化石“嘉伯人”曾经轰动一时。考古学家杜波瓦在嘉伯发现了一块很象猿的头盖骨的骨片，在40英尺以外又发现了一块大腿骨。他说，显然这是属于同一个生物的。这个生物象人一样直立行走，又具有猿一样的头骨，这一定就是那个过渡环节。但后来证实这分别属于一百万年前一起生活在嘉伯的一个猿和一个人。学术界否定了“嘉伯人”，科教方面却还在宣传。直到1984年“嘉伯人”才被新发现的猿人化石“露茜”代替。但后来的鉴定中，露茜同样被否定了，科学家已经确定了露茜是一种绝种的猿--南方古猿阿法种，和人无关。而教科书中，对始祖鸟和露茜还是不予更正，公众也就不知真相了。
拉玛古猿被认为在从猿到人的进化中具有重要意义。它的下颌骨兼具人类与猩猩的特征，牙床结构类似于人，不具有猩猩的门齿与犬齿，但上下颌的距离与颌骨的长度又近似于猩猩，这被视为是进化论的一个铁证。然而后来在非洲发现的一种狒狒与拉玛古猿具有相同的牙齿及面骨特征，但却被视作一种狒狒。由此可见，这个判据也是模棱两可的。
假如进化存在，过渡类型化石就应该很容易找到，为什么没有呢？大家沿用达尔文的解释：化石记录不完全。深入一想：化石的形成是普遍和随机的，为什么单单漏掉了过渡类型呢？《审判达尔文》一书的作者约翰逊（Philip Johnson）做了这样的总结：‘化石向我们展示的都是突然出现的某种有机体，没有逐步进化的任何痕迹......这些有机体一旦出现，基本上就不再变了，哪怕过了几百万年，不管气候和环境如何变化，也不变了。如果达尔文的理论成立，这些条件本应该引起物种的巨大变化。古生物学家古尔德（Stephen Jay Gould）和埃尔德里奇曾根据地质历史的事实，提出了一个‘间断平衡‘假说，来说明过渡类型形成化石机率较小，但不能解释为什么过渡类型根本不存在，而且该假说的进化机制在基因水平上看，是绝对不可能的。
达尔文对自己理论的最终归宿评价道：“如果可以证明任何复杂的器官不能通过无数的，持续的，微小的改变形成的话，我的理论将绝对失败”。寒武纪生物大爆炸恰恰提供了一个极好的反例。大约在五亿三千万年前，在短短的几万年内，几乎现在所有生物的门同时出现在地球上。从海洋里巨大的管状蠕虫，甲壳类到较为高级的脊索动物并存。如果进化确如达尔文所言由点滴的，渐进的方式进行，那么数百万年的时间无论如何也不足以完成这一历程。在寒武纪之前，不仅多细胞生物化石非常稀少，而且在以埃迪卡拉动物群为代表的、迄今所发现的新元古代的各种化石中，尚无一种可以确认为已知动物门的祖先。也就是说，绝大多数动物门类是在寒武纪突然出现的。现代达尔文主义者亦无法解释，称之为“谜中之谜”，事实上寒武纪生物大爆炸是进化论不可逾越的障碍。
在《物种起源》发表之际，达尔文曾说：“只有人类的进化，怎么都不可能用我的进化论来说明”。的确，从进化论的观点来看，人类的进化太快了。以人为例，进化论者认为，人类诞生的历程为：南方古猿(200万年前) ----原人(50万年前) ---- 旧人(10万年前)----新人(5万年前) ---- 现代人类(5千年前)在这一过程中，人脑容量以爆炸般的速度增大。而现代人类产生后，进化又似乎突然消失了，五千年来人的脑容量基本未变。再看脑细胞数量，现代类人猿为10亿个，而现代人类约为140亿个。单从数字上看是增大了14倍，但智力水平却发生着跳跃性的变化，这些证据强烈地暗示：这个进化树是不正确的。这些物种也许根本没有任何亲缘关系，而进化论者只是按时间顺序把它们拼凑在一起而已。
六十年代以来，肯尼亚OLDUVAI峡谷和RUDOCF湖附近地区的考古发现，也给进化论提出了许多反例。1972年出土了一具类人动物的头骨化石，编号为KNM-ER-1470，简称1470 号人。按其分类特征，它类似于现代人，属于人属，比南方古猿和直立猿人要进步得多，但它却处于 290万年前。1470号人比进化论者所公认的人类始祖南方古猿早九十万年，比直立猿人早二百万年。这从根本上动摇了进化论的证据，成为古人类学中的一件悬案，至今没有一个进化论者能够归属1470号人在进化树中的位置。
8.2.4 不可回避的化学进化
生命产生前在分子水平上的进化被称为化学进化。完整意义上的进化论，不仅要回答生命产生后的生物进化过程，而且还要解决生命物质是如何产生的问题。即怎样由简单，无机的小分子进化到复杂，有机的大分子，进而产生生命体。但这个问题被进化论者们故意地回避了。
《达尔文的黑箱》(Darwin‘sBlackBox)一书的作者Behe教授，对数种有关进化分子生物学的学术期刊近十年来所发表的上千篇文章的研究表明，在这方面的进行的工作是零。化学进化被回避的原因很简单，是因为进化论者根本无法回答。流行的观点认为，原始地球拥有还原性大气，含有氮，氢，硫化氢等成份，不含或含少量的氧。大气放电经常发生，原始海洋中水温较高，并有频繁的地质活动，如地震，火山喷发等。基于这种观点，1951年 STANLEY MILLER进行了著名的“原始汤”实验，他在一个烧瓶中模仿原始地球的环境，用气体放电模拟雷电。实验结束后，在产物中分离到了氨基酸，这个结果轰动了科学界。但更多的问题暴露后，乐观主义渐渐消失了。我们仅举两例，说明他们的困境。
A.化学选择性
所有生物大分子结构均表现为空间上的有序，蛋白质分子除了特定氨基酸的连接外，还能形成2-螺旋；BETA-折叠等二级结构；结构域等三级结构；直至形成四级结构---亚基。双链DNA分子由两条单链组成，除单个核甘酸的连接与氢键作用外，还能形成双螺旋和超螺旋，所有这些结构都与该大分子的功能紧密相联。一旦这些结构遭到破坏，该大分子就会失活，所以生物体在合成生物大分子时表现出极高的精确性。
假设第一条具有生命功能的多肽链出现在原始海洋中，其序列为A，B，C...(A，B，C...代表天然的人体所需的二十种氨基酸)。其形成必然条件是：
(1)A，B，C...等具有足够的浓度，这样A，B，C分子才有可能相遇而发生反应。
(2)从氨基酸形成多肽的反应是缩聚反应，每步反应会生成一分子水，从化学平衡的原理看，反应需要脱水剂，否则水将抑制该反应。
(3) 假设A与B的结合是随机的，而结合C时是选择性的，按热力学原理，这是一个熵减的反应，必须得有外界能量的输入。如果以上三个条件全部成立，那么C到底是由什么因素决定而被选择的呢？进化论者只能回答：绝对的随机。但在自然环境中，上述三个条件决不可能同时满足，这个随机过程缺乏先决条件。另外，从科学哲学的角度来看，进化论者的答案是不可能被证伪的，而且在经验世界中是不可检验的。
Behe教授在谈到这个问题时举了一个形象的例子，蛋白质绝对随机，自然地产生，就如同一个人期望将热水、面粉、糖、可可粉，随机放在一起（而不进一步人为有意介入精确量化并且搅拌烘焙）就能产生一个巧克力糕点一样荒唐。
B.光学选择性
生物世界是一个不对称的世界，如果你注意观察过你的手，你会发现左右手在空间上无法完全重合，但左手和右手的镜像却能重合。在化学中这种现象被称之为“手性”，几乎所有的生物大分子都是手性的。比如，组成人体的糖类一般是右旋的，而构成蛋白质的氨基酸都是左旋的。而左旋的糖和右旋的氨基酸，几乎不能被人体利用。一般认为，在非手性的环境中不能产生手性化合物，而只能产生外消旋体，即等量的右旋和左旋体构成的混合物。现代不对称合成化学通常采用最昂贵的手性催化剂，才能使反应按照人所期望的方向进行，得到单一的手性化合物。在MILLER的“原始汤”实验里，所有得到的氨基酸都是外消旋体。假如还用前文所举的例子A-B-C...序列，又是谁选择了左旋的氨基酸呢？众所周知，最简单的蛋白质是胰岛素--51肽，那么由自然界随机地从二十种天然外消旋体中选择合成一个51肽，得到全部由左旋氨基酸构成，具有生物活性的胰岛素分子的几率有多大呢？简单的数学计算可以证明是(1/40)的51次方。而在实践中，其几率是零，根本就不可能发生。MILLER的实验带给进化论者的并不是福音，而是更加剧了其深刻的危机。
8.2.5 概率计算表明，生物进化的可能性小到了绝对不可能的程度
达尔文时代，科学正处于奠基阶段，对生命现象的认识还很肤浅。那时的人看到了家养动物的诸多杂种变异，就认为物种也能这样变成其它种，这就是进化。后来，基因的发现和深入研究，学者们才意识到如果基因不发生根本的变化，不管后代表面与祖先有什么差异，也没有进化意义。然而基因又是极其稳定的，只有不正常的 “基因突变”才能使之发生改变，那么“基因突变”也就成了现代进化论的核心了。这是现代所有的进化论公认的。这里，我们就集中分析这个核心。
基因的稳定性是物种保持自身稳定所必须的，同一物种不同个体的基因交流，并不能使物种变成其它物种。动植物育种专家都知道，一个物种的变化范围是有限的。最终，培育出的品种不是不育，就是又变成原来的亲本。哈佛大学的梅尔教授称之为基因体内平衡。最常见的就是狗再怎么杂交育种还是狗。
现代进化论用基因随机突变假说解释进化的根本原因。基因突变，是一种在基因复制或修复损伤等过程中的随机错误，所以又叫随机突变，本身就是一种病态现象。它发生的机率非常低，大约在万分之一到十亿分之一之间。低等原核生物的突变率较高，大约为千分之一，而高等类型的生物中，许多基因的突变率是十万分之一到一亿分之一。基因突变能否产生高级特徵（性状）呢？对基因的深入研究发现这种情况发生的几率极低。我们知道一个基因的核心是由几百到几千个碱基排列而成，四种不同的碱基按照一定规则排列，不同的排列顺序形成了非常复杂精密遗传密码。既然基因突变是随机的差错，我们就可以用简单的随机过程来分析：
我们来考虑一下这个问题：一个复杂精密的计算机程序，随意的改动一两个字符能够产生更高级的程序吗？当然不能。基因突变也是这样。差错造成的突变一般是单个碱基的变化，这种变化造成的结果往往是各种缺陷、畸形、致死，在自然条件下具有生存优势的没有发现一例。为了增加突变率用于研究，科学家们使用了各种方法增加突变的几率，制造了大量的突变体，也没发现向高等方向进化的类型。
基因突变具有随机性、低频率和不定向等，那么就可以用概率计算进化的可能性了。值得注意的是，在数学公式和模型普遍应用于生物学领域的今天，进化论者从来没有提出公式，计算基因突变机制实现进化的机率，因为任何一个合理的公式都会否定进化。
许多学者从概率上证明了现代进化论的错误，美国生物化学家Behe教授的《达尔文的黑箱》(Darwin‘sBlackBox)一书，多处从生命结构的复杂精密性否定了进化的可能。Behe以血液凝固的一系列生物化学机制为例，讲述如此复杂精密的生命现象不可能是进化出来的。其中一个蛋白（TPA）产生的几率是1/10的18次幂，至少需要100亿年才能发生。如果同时进化出和它相互作用的蛋白，几率就是1/10的36次幂……他说：“很可惜，宇宙没有时间等待”。
这里提出一个宽松的公式，根据突变机率计算进化产生新物种的概率：P ＝（ M · C · L · B · S ）^ N
M 为一个物种的某个体发生了突变（机率只有1/1000）；C为突变基因与自身其它基因在不同层次的产物上可以相容的概率（宽松估计 1/100）； L表示在生存竞争中该个体能够存活，且有繁殖的机会（1/10）； B表示该突变恰好有纵向进化的意义，即是有益的的进化（事实上绝大多数突变都是有害的，这种情况至今没有发现，姑且估计为1/1000）； S表示突变基因在种群中能够稳定下来并扩大的概率（1/100）； N表示新物种出现所需要的一系列的基因的个数，因为新物种的形成需要一系列新基因的出现，假设要 10 个（幂指数 N ＝10 ，实际物种间绝对没有这么小的基因差异），那么进化出一个新物种的概率就是：P＝（1/1000·1/100·1/10·1/1000·1/100）^ 10 = 10^-110
按照一年繁殖10代，种群个体数为1000，相应的进化所需要的时间极为宽松的计算也需要 10^106年。目前科学认为宇宙中所有基本粒子总数只有10^70个，宇宙年龄只有200亿(2×10^10)年，进化一个新物种的时间，是宇宙的年龄的自乘10 次，足见进化是绝不可能的。生物最相近的物种也不可能只差10个基因，高等生物和低等生物基因差别上万，生物从低等到高等进化所需要的时间更是无法想象的了。
对于生命的产生，现代进化论认为也是一个自然过程，认为简单的有机物和无机物在某种特殊条件下进化成复杂的生命大分子，各种复杂的大分子进一步组合演化组合形成原始生命。读到这么多串连的“理想化”过程，读者恐怕会考虑其中的几率问题了，Fred Hoyley 曾说过：上述事情发生的可能性正如利用席卷整个废料厂的飓风来装配747喷气机一样。
8.2.6 现代进化论对于进化的速度问题，理论和事实自相矛盾
达尔文时代，人们还不知道基因的存在，不知道后天的外在变化，如果涉及不到基因的改变是无法遗传的，没有任何进化意义。现代进化论认定基因的变化是进化的根本原因，因为只有这种变化可以遗传、积累，而基因突变是基因变化的最主要原因。复杂的高等生物的进化决不可能是单个基因的变化实现，必须一些相关基因的协调进化才能实现，就象一个复杂的计算机程序不可能一个随机的错误变成更高级的程序一样。那么相关基因的协调变化，就使高等生物总体突变率更低。因为基因突变在宏观上是减速趋势。
分子生物学研究表明：生物从低等到高等，个体水平的基因突变率呈下降趋势。现代分子生物学已经证明：基因是生命的基础物质，是生长发育和遗传变异的基础。除了一些低等的病毒以外，基因是DNA分子构成的，DNA分子是许多碱基小分子连成的长链大分子。细胞分裂时一分为二，基因事先已经复制了一份。基因的复制能够高度地保持稳定，其间由于各种原因发生的差错，是基因突变的一种主要形式，现代进化论认为这是向高等生物进化的源泉。自然界突变的发生率是很低的。大约在万分之一到十亿分之一之间。低等原核生物的突变率较高，大约为千分之一，而高等类型的生物中，许多基因的突变率是十万分之一到一亿分之一。
基因突变本身是一种病态，所以又叫做畸变，对生物本身是十分有害的。绝大多数突变都是畸形的，自然条件下存活率很低，突变产生向更高等物种进化的迹象至今没有发现。一些学者把突变的概念拓广，把所有基因的变化，包括不同个体的基因交流都叫成突变，其实只有原来狭义的突变才有向高等生物进化的意义，举例说：孩子长得有不象父母的地方，如果这都被称为基因突变，没有进化意义可言。事实上，按进化思路推论，所有生物都在极力避免突变的发生：
（a）从原核生物到真核生物，细胞核的出现更好地保护了基因，防止损伤导致突变的发生。
（b）DNA大分子从突变无法修复的单链到可以修复的双链螺旋，再到较为高等的生物拥有两套基因组（二倍体，一般只启用一套），宏观趋势明显在降低突变发生率。
（c）绝大部份生物的基因是双链DNA分子，复杂的基因复制机制极大限度地降低了突变的发生。热力学稳定性、酶对原料的精确选择，酶对错误组分的切除，三者使错误率降低到百万分之一。
（d）DNA复制结构的精密复杂性进一步降低了突变发生率，生物越高等，基因系统的结构越复杂，所以突变率更低。
（e）针对DNA损伤的突变修复机制，进一步减少了突变的发生
（f）近来又发现在某些DNA损伤处可以较高比例地合成正确DNA，这类结构，高等生物也比低等生物复杂。
由此进化论者必然得出结论：宏观上，物种的进化呈 “减速进化趋势” 。
然而，进化论中根据化石得出的结论恰恰相反：进化在整体上表现出“加速进化规律” 。认为生物的进化是加速发展的，形态愈高，进化愈快。
按照进化论的说法：从没有细胞核的原核生物进化到原始的有细胞核的真核生物，历经14亿年；再经过9亿年，低等无脊椎动物已经大面积出现； 1亿年后，高等无脊椎动物已经进入繁盛阶段；6千万年后，脊椎动物----鱼类出现；4千万年后，两栖类出现……从原始人类到人类进入文明只用了不到 300万年；而人类文明的发展至今不到1万年。呈明显的加速进化趋势。
两个结果明显对立了。
为什么会得出如此自相矛盾的结果呢？要知道：加速进化趋势是有“事实”支持的；而基因突变的进化机制又是唯一的可能，分子生物学的研究也不是编造的证据，论证也完全按进化的逻辑来的，大家都按进化论的思想入手研究，结果却这样自相矛盾？那只可能是根子上错了。这是进化论本身的问题。