总有一些科学发现,会令人不禁感叹,生命的构造真是奇妙又精美。近期顶级期刊《细胞》杂志刊登的论文就给我们带来了这样一项发现[1]。
纽约大学朗格健康学院的科研团队通过单细胞测序发现, 精子中高达九成的基因处于活跃的转录中,并通过这一程序来修复DNA损伤,减少突变。可以说, 精子细胞的转录水平远远高于其他细胞,正是一种为了保持遗传稳定的“自我检查”。更神奇的是, 剩余的10%基因也不是“弃子”,这部分基因多与免疫、感觉功能相关,更高的突变速率能够帮助机体在面对外界不同环境时尽快适应。
这简直就是冥冥有天意,生命真神奇啊~
其实生殖细胞的特殊之处,很早就有科学家发现了。我们知道,人体内的每个细胞其实都含有这个人的全部基因信息,但是却不是所有的基因都会在同一时间表达, 但是睾丸却表现得异常鹤立鸡群,超过80%的编码基因都是处于转录中的[2]。
睾丸如此这般是为啥?科学家们也提出了一些假设来试图解释。最初的假设很直观:转录,说明功能有需要嘛。
但是细一想,这事儿不对,主要证据有三。一,人体这么多器官,要说功能和结构复杂,没谁能够比过大脑,可就算大脑表达基因的比例也没有这么高[3];二,有许多研究表明,就算敲除睾丸中高表达的部分基因,雄性小鼠照样能够生儿育女[4];三,对比转录组和蛋白质组,结果并不一致,也就是说高转录的基因并没有都翻译成为有功能的蛋白质[5]。
可见这些基因,表达出来还真的没有什么特殊用处。
另外一种假说则认为,由于精子形成涉及大规模的染色质重构,我们所观察到的转录其实是染色质重构造成的一种“泄漏”。不过这个假说也有些站不住,因为按照这个理论,在精子形成的后期应当表达水平比早期还高,但是真实情况却是完全相反的[6]。再说了,转录需要的能量可是非常多的,细胞也不傻,不会做这种无用功。
今天要说的这项研究则提出了一个全新的理论,科学家们把它命名为 “转录扫描(tranional scanning)”。简单来说, 大规模的转录其实是为了利用转录过程所附带的“转录耦合修复(TCR)”,系统地检测和修复DNA损伤,避免基因突变,保持遗传稳定。
研究者利用单细胞测序技术分析了人类和小鼠的睾丸细胞,分析结果表明, 精子中编码基因的表达比例竟然高达90.5%。与此相对的,其他的体细胞表达比例仅有59.9%。
这个现象肯定不寻常,研究者们想到了两种后果:要么,高水平转录导致突变增加,以致基因的多样性增加;要么,伴随转录的修复增加,降低基因突变率,以致基因组更稳定。
与公开的数据库对比之后,研究者发现,后者才是正确答案。 与不表达的基因相比,那些积极转录的基因突变数量要少得多,部分类别甚至能降低20%以上。
显然,这种大规模转录事实上构成了对基因组的保护。
那么还有10%的没有转录的基因呢?
研究者分析了这部分基因的功能, 发现主要涉及环境感知、免疫系统、防御反应等功能,而这些基因本身在人类的基因组中的进化速度就更快[7]。可以猜想,这部分基因在精子中不表达,可能有助于加速它们的进化。
这样看来,精子的高转录现象真是对进化速率的一次精巧调节,我们的生命简直太神奇辣。
参考资料
[1] Widespread Tranional Scanning in the Testis Modulates Gene Evolution Rates, Cell, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.12.015
[2] Cellular source and mechanisms of high tranome complexity in the mammalian testis.Cell Rep. 2013; 3: 2179-2190.
[3] The evolution of gene expression levels in mammalian organs. Nature 478, 343–348.
[4] Genome engineering uncovers 54 evolutionarily conserved and testis-enriched genes that are not required for male fertility in mice. Proc. Natl. Acad.Sci. USA 113, 7704–7710.
[5] A deep proteome and tranome abundance atlas of 29 healthy human tissues. Mol. Syst. Biol.15, e8503.
[6] An orchestrated intronretention program in meiosis controls timely usage of trans duringgerm cell differentiation. Dev. Cell 41, 82–93.e4.
[7] The evolution ofgene expression levels in mammalian organs. Nature 478, 343–348.